Microcredencial Aplicación de la genómica a la investigación de las enfermedades infecciosas

1. Comprender los fundamentos conceptuales y metodológicos de la genómica aplicada a las enfermedades infecciosas, incluyendo los principios de la secuenciación masiva, el análisis bioinformático y la interpretación biológica de datos genómicos microbianos.

2. Capacitar al estudiante para el diseño y ejecución de estudios genómicos en el ámbito de la microbiología y la epidemiología molecular, orientados a la caracterización de patógenos, la vigilancia de brotes y el estudio de la resistencia antimicrobiana.

3. Fomentar la integración de la genómica con otras disciplinas biomédicas - como la proteómica, la metagenómica o la bioinformática clínica - para la comprensión de la patogenia, la dinámica poblacional y la evolución de los agentes infecciosos.

4. Desarrollar competencias analíticas, críticas y comunicativas que permitan interpretar resultados genómicos, elaborar informes científicos y trasladar los hallazgos a la práctica clínica, la salud pública o la investigación traslacional.

Graduados o licenciados en Medicina, Biología, Biotecnología, Farmacia, Microbiología, Veterinaria o Ciencias Biomédicas.

Módulo 1. Fundamentos conceptuales de la genómica microbiana

1.1. Introducción a la genómica de patógenos humanos. Conceptos básicos, evolución de la genómica microbiana, relevancia en investigación y salud pública.

1.2. Técnicas de secuenciación de ADN y ARN. Principios, tecnologías NGS (Illumina, Nanopore, PacBio) y sus aplicaciones en microbiología y diagnóstico.

1.3. Análisis de secuencias y diseño experimental de proyectos de secuenciación Estrategias de diseño, control de calidad y preparación de datos para análisis genómico.

Módulo 2. Reconstrucción e interpretación de genomas

2.1. Reconstrucción de genomas: estrategias de ensamblaje y anotación. Métodos de ensamblado y anotación funcional de genomas bacterianos y virales.

2.2. Identificación de genes de interés: virulencia, resistencia, adaptación y colonización. Análisis de genes determinantes de patogenicidad y resistencia antimicrobiana.

2.3. Análisis de pangenomas: genoma “core” y genoma accesorio. Conceptos y métodos de pangenómica; implicaciones evolutivas y epidemiológicas.

Módulo 3. Genómica comparada y epidemiología molecular

3.1. Análisis filogenéticos en un contexto epidemiológico. Construcción e interpretación de árboles filogenéticos aplicados a brotes y vigilancia.

3.2. Reconstrucción de la historia evolutiva de organismos patógenos. Mecanismos de evolución, recombinación y transferencia genética horizontal.

3.3. Dinámica de transmisión y dispersión de patógenos durante epidemias. Integración de datos genómicos, espaciales y temporales para inferir rutas de transmisión.

Módulo 4. Aplicaciones clínicas y metagenómicas

4.1. Aplicación de la metagenómica en el ámbito clínico. Identificación de patógenos complejos y análisis de comunidades microbianas en muestras clínicas.

4.2. Microbiomas y salud. Relación entre microbiota, disbiosis, susceptibilidad a infecciones y respuesta

inmunitaria.

COMPETENCIAS:

1. Realizar investigaciones sobre el genoma.

2. Genómica de agentes infecciosos en medicina.

3. Interpretar datos de secuenciación sobre genómica.

4. Gestionar bases de datos

Nivel de cualificación: Nivel MEC 6

En la siguiente tabla se presenta la relación entre los MECES (Marco Español de Cualificaciones para la Educación Superior) y MEC (Marco Europeo de Cualificaciones).

Recomendaciones:

El curso está dirigido a profesionales y titulados universitarios del ámbito biomédico y sanitario interesados en adquirir competencias avanzadas en el uso de herramientas genómicas aplicadas a la investigación de las enfermedades infecciosas.

Formación previa recomendada:

- Conocimientos fundamentales en genética microbiana, patogenia e inmunología.

- Competencias básicas en manejo de bases de datos y comprensión de artículos científicos en inglés.